Fu costruito verso il 1568 dai frati Minori Osservanti che avevano ricevuto in dono dall'Arcivescovo Giovanni Carlo Bovio, L'orto, il terreno, la torre e gli edifici attigui la Chiesa.
In seguito, con l'avvento dei Padri della Serafica Riforma nel 1589 e con la trasformazione del convento per farlo corrispondere agli ideali radicali di povertà, negli anni 1635-38 il chiostro fu completato.